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Cell:重大进展,中国科学家首次揭示肺腺癌蛋白质组完整图谱

作者:admin      来源:admin      发布时间:2020-09-04

导语:肺癌是发病率和死亡率增加最快,对人群健康和生命要挟最大的恶性肿瘤之一。而肺腺癌约占肺癌总数的一半。近来,来自中科院等国内多家安排的科学家初次在国际上提醒了肺腺癌蛋白质组完好图谱,为肺腺癌的精准医疗供给了名贵资源。

虽然近年来,肺腺癌的基因组研讨取得了明显发展,但仍有很大份额的LUAD患者仍缺少针对性的医治战略。而因为蛋白质是生命活动的直接执行者,因而对LUAD进行全面的蛋白质环亚国际娱乐场组学研讨,能够添补基因组反常与致癌蛋白质功用之间的常识空白。近来,中科院等国内多家安排的科学家初次在国际上提醒了肺腺癌蛋白质组完好图谱,为肺腺癌的精准医疗供给了名贵资源。

这项研讨经过蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,转录组和全外显子组测序数据的归纳剖析,提醒了LUAD相关分子特征、其与临床成果的相关、潜在的预后生物标志物和药物靶标,并于7月9日在线发布在《Cell》上。标题为 Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma

为了全面了解LUAD的分子结构,并为LUAD更准确的确诊和医治供给根底,科学家们在本研讨中对103例LUAD患者的肿瘤安排及其对应的非癌性附近安排进行了蛋白质组学和磷酸蛋白组学剖析。共判定出11119个蛋白质和22564个磷酸化位点。将这些蛋白质组学数据与临床信息和基因组学数据相结合,得到了LUAD的一个全面的分子图谱。


图形摘要


科学家们发现,上皮-间质转化以及炎症和致癌信号通路,很可能导致I期LUAD的不良预后。他们进一步建立了EGFR或TP53骤变患者的基因改动和蛋白质组学特征之间的联络,EGFR或TP53是我国LUAD患者的两个首要驱动基因。

在EGFR骤变患者中,观察到两种安排学标志物TTF-1和Napsin-A以及剪接体中蛋白质的表达水平升高。在TP53骤变患者中,包含DNA仿制和错配修复在内的多种致癌途径发生了明显改变。

研讨人员将一切患者分为三种蛋白质组亚型,每种亚型均具有共同的分子特征和临床特征。全面的生物信息学剖析显现,S-I患者与细胞环境和杰出的预后相关。相比之下,S-III患者与细胞增殖和蛋白质组稳定性以及预后不良有关。磷酸蛋白质组学剖析进一步提醒了不同蛋白质组学亚型中激活的信号通路和激酶。蛋白质组学数据和临床数据的归纳剖析进一步提醒了27种潜在的血浆生物标志物和LUAD的多个药物靶标。其间,研讨人员指出,HSP 90 是潜在的生物标志物之一,并已在一个独立行列中得到进一步验证。

这项工作为LUAD的研讨供给了新见地,逾越了当时的基因组研讨。我国科学家在国际上初次对肺腺癌展开了大规模、高通量、系统性的全景蛋白质组学研讨,在基因组学,转录组学,蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学水平上建立了我国LUAD的完好图谱。该蛋白质组数据集作为一种名贵和强壮的资源,将加速根底研讨转化为临床实践中更精准的确诊和医治。

原始出处:

Jun-Yu Xu, Chunchao Zhang, Xiang Wang, et.al. Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma. Cell VOLUME 182, ISSUE 1, P245-261.E17, JULY 09, 2020